处理审计纠纷的方法可以归纳为以下几点：
倾听与沟通
一听：允许被审计单位表达异议，仔细倾听其申诉，确保对争议焦点有大致了解，并进行充分沟通确认，避免理解偏差。
确认主体资格与救济途径
确认审计活动中各方的行政法主体资格。
在行政法制监督关系中，被审计单位作为行政主体，救济方式是申请行政复议；行政机关以外的金融机构、企事业单位作为被审计单位，救济方式是行政复议或行政诉讼。
分析原因与具体情况
了解审计不合理的原因和具体情况，包括审计程序、数据来源、审计人员等方面的问题。
协商与投诉
与审计机关进行沟通和协商，尝试解决问题，可以提出自己的意见和建议，或者要求重新进行审计。
如果无法通过沟通和协商解决问题，可以考虑向上级主管部门或相关监管机构投诉或申诉。
法律途径
如果上述方法都无法解决问题，可以考虑通过法律途径维护自己的合法权益，如申请司法鉴定等。
回避与迁就
在某些情况下，适当回避或迁就能有效减少冲突，例如在审计工作中，适当考虑对方的意见，不掩盖事实，不影响问题的整改。
强制与妥协
在双方势均力敌且不影响大局的情况下，可以采取强制手段，如不听建议就罚、通报或上报老板。
妥协则是双方各让一步，达成共识。
提供证据与法律救济
提供证据证明审计机关的审计意见存在不真实、不客观情形，人民法院可以准许当事人补充鉴定、重新质证或补充质证等方法纠正审计意见存在的缺陷。如果这些方法不能解决问题，应当准许当事人申请对工程造价进行鉴定。
通过以上方法，可以有效地处理审计纠纷，维护各方的合法权益，并促进问题的妥善解决。
