箱货车主要归 交通运输部门管理。具体来说，交通运输部门负责包括货运市场在内的多个市场的管理许可和监督，还负责驾驶货车时的相关法规遵守情况，例如不得超载等。此外，根据《中华人民共和国道路运输条例》，道路运输管理机构具体实施本行政区域的道路货物运输和货运站管理工作，而县级以上人民政府交通主管部门则负责组织领导这些工作。
如果涉及到特种集装箱或危险品运输，可能还需要办理相应的特种许可证和危险品运输许可证。而关于噪音扰民问题，大货车噪音扰民归警察和生态环境主管部门管。
综上所述，箱货车的管理主要涉及交通运输部门，具体职责包括市场管理、许可监督、法规遵守等。如有其他特殊情况，如特种运输或噪音扰民，则可能涉及其他相关部门。
